Guna menghindari agar jangan sampai menyumbat arus air, sejumlah pasukan oranye hampir setiap hari melakukan pembersihan sampah dan eceng gondok di BKT Marunda.
Meski sudah dibersihkan, namun kondisi BKT yang melintasi Kelurahan Rorotan, Kecamatan Cilincing, Jakarta Utara sampai saat ini sudah mengalami penyempitan karena sepanjang bantaran itu dipenuhi tumbuhan enceng gondok, sehingga membuat debit air yang mengalir di kali tidak lancar.
Tumbuhan liar ini terlihat mulai dari bawah kolong jembatan Karang Tengah Rorotan sampai ke Jembatan Sungai Kendal dan jembatan Bulak Turi.
Selain dipenuhi enceng gondok, Kali BKT juga dipenuhi sampah rumah tangga yang tersangkut di antara tumbuhan enceng gondok, jika pada musim seperti ini tidak segera dibersihkan di khawatirkan akan menimbulkan banjir.
Dalam pembersihan itu petugas selain menggunakan alat berat berupa beko juga secara manual dengan menggunakan getek.