Di Dermaga Wijayapura, sterilisasi mulai dilakukan dari pertigaan masuk menuju dermaga, polisi memasang portal untuk memeriksa kendaraan yang akan masuk.
Sterilisasi juga akan dilakukan di perairan sekitar Pulau Nusakambangan oleh TNI Angkatan Laut dengan menggunakan KAL Serayu, yang meminta nelayan agar tidak melintas di sekitar perairan Nusakambangan.
Selain itu, polisi juga memasang water bariel disepanjang jalan masuk menuju gerbang dermaga Wijayapura. Hal tersebut dilakukan agar jalur masuk dan keluar dari dermaga bagi kunjungan keluarga, jaksa ataupun polisi yang hendak menuju atau kembali dari Pulau Nusakambangan bisa lancar.
Kendaraan-kendaraan yang tidak berkepentingan harus diparkir di luar area sterilisasi.